側(cè)孢短芽孢桿菌是一種桿狀、產(chǎn)內(nèi)生孢子的兼性厭氧細(xì)菌。在營養(yǎng)瓊脂培養(yǎng)基上的菌落不透明，表面光滑，芽孢為橢圓形，側(cè)生，孢囊膨大。

最初由White等于1912年發(fā)現(xiàn)，人們對(duì)該菌的研究迄今已有100多年的歷史。具有很好的抗菌殺蟲效果，也有很重要的醫(yī)用價(jià)值。

側(cè)孢短芽孢桿菌具有多種生物活性，抑菌譜寬，對(duì)細(xì)菌、真菌和部分蟲害都有很好的抑制效果，還能產(chǎn)生多種有應(yīng)用潛力的代謝產(chǎn)物，如抗菌物質(zhì)、殺蟲蛋白（氨基肽酶抑制劑）等，但卻是哺乳動(dòng)物和鳥類的益生菌。
我國從蘋果根際分離出的一株側(cè)孢短芽孢桿菌對(duì)蘋果樹致病菌，如立枯絲核菌、尖孢鐮刀菌、煙草赤星病菌、蘋果炭疽病菌等均有抑制作用。
側(cè)孢芽孢桿菌抑菌物質(zhì)對(duì)青枯病菌有強(qiáng)烈的抑制作用，對(duì)真菌及病菌具有拮抗作用，是一種有開發(fā)潛力的生防菌。

應(yīng)用表明，多種側(cè)孢短芽孢桿菌對(duì)無脊椎動(dòng)物如昆蟲、線蟲和軟體動(dòng)物具有致病性，抑制其卵孵化和幼蟲發(fā)育，相同生物的量比蘇云金芽孢桿菌對(duì)黃粉幼蟲的毒性更高，還有一定的殺蚊、殺蠅、殺死梨形四膜蟲的作用。

國外有研究報(bào)道，從側(cè)孢短芽孢桿菌的發(fā)酵液中分離得到一種新型的抗菌素——芽孢菌胺，該抗菌物質(zhì)具有良好的熱和酸堿穩(wěn)定性，并具有廣泛的抑菌譜。
除了殺蟲效果，側(cè)孢短芽孢桿菌也具有一定的解磷、解鉀功能，可降解有機(jī)污染物。
在醫(yī)學(xué)上主要是治療腸胃紊亂及其代謝產(chǎn)物制備抗生素類藥物，是很有前景的菌株。

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